Dette prosjektet vil undersøke hvordan modulering av fordøyelses- og respirasjonsmikrobiomene, og interaksjoner mellom disse to mikrobiomene, kan påvirke vertens mottakelighet for en rekke patogener, inkludert bakterier, virus og parasitter. Prosjektet vil også utforske patobiomet, forstått som patogenet i det omkringliggende mikrobielle samfunnet, i forskjellige kontekster og under varierende forhold for å avklare dets sammensetning, dynamikk og rolle i sykdomsutfall. Parallelt vil prosjektet undersøke hvordan patogener tilpasser seg miljøet sitt, inkludert de molekylære mekanismene som ligger til grunn for tilpasning og miljøfaktorene som former eller modifiserer disse prosessene.
Prosjektet består av fem oppgaver:
Oppgave 1. Studere dynamikken og kompleksiteten til patobiomer hos drøvtyggere
Oppgave 2. Effekter av genetikk, mikrobiomer og mikro-/nanoplast i tarm- og luftveiene hos svin og innvirkning på utfallet av patogeninfeksjoner
Oppgave 3. Patogener som smitter fjørfe
Oppgave 4. Interaksjon mellom vert, patogen og miljø i akvatiske økosystemer
Oppgave 5. Patobiomer hos ville dyr og vektorer
Samarbeidspartnere:
ANSES
AU
BfR
CIRAD
CSIC
DEFRA-APHA
DTU
EDI-IVI
EULS
INRAE (Chair)
IRTA
ISS
IZS-Teramo
IZSLER
NVI
PIWet
Sciensano
SSI
SVA
TiHo
UAB
UCPH
UEDIN ND
Ugent
UL
UNIPD
UNITUS
WR
WU
