BIORESIST: Påvirkning av biocider på antimikrobiell resistens hos enterobacterales i en én helse-sammenheng

Den omfattende bruken av antimikrobielle midler til produksjonsdyr i tidligere tider har gjort det mulig for husdyrproduksjonen å vokse, samtidig som smitteoverføring av patogener ble holdt under kontroll. Ettersom dette førte til seleksjon og spredning av antimikrobiell resistens (AMR), har mange land nå innført restriksjoner på antibiotikabruken og rettet innsatsen mot sykdomsforebygging.

Desinfeksjon av fjøs og utstyr med biocidholdige kjemikalier har blitt standard, men resistens mot biocider finnes også i ulike bakteriesamfunn. Den omfattende bruken av biocider kan føre til seleksjon for resistens mot biocider, på samme måte som for AMR-gener. Spesielt dersom biocidresistens forekommer i AMR-bakterier, kan bruk av biocider bidra til indirekte seleksjon av AMR.

Som del av nasjonale handlingsplaner mot AMR, har mange land begynt å overvåke bruk av antimikrobielle midler og forekomst av AMR-bakterier i matkjeden. I EU er harmonisert overvåking nå obligatorisk, og overvåkningen har vært etablert i flere år ved nasjonale referanselaboratorier (NRL).

Ettersom helgenomsekvensering (WGS) har blitt mere tilgjengelig, kan NRL bruke disse dataene til å undersøke forekomsten av biocidresistens og bekrefte en eventuell sammenheng med AMR. Videre kan WGS-datagenerering fra deres isolatsamlinger indikere endringer over tid.

I lav- og mellominntektsland har bruken av antimikrobielle midler og biocider historisk vært annerledes. Det vil derfor bli gjort sammenligninger av WGS-data fra innsamlede isolater, samt også av bruken av og holdningene til antimikrobielle midler og biocider i europeiske land og i et lav- og mellominntektsland i Afrika.

Det overordnede målet for BIORESIST er å vurdere om de potensielle effektene av økt bruk av biocider kan påvirke indirekte seleksjon for antimikrobiell resistens (AMR) i ulike én helse-reservoarer.
 

Delmål inkluderer:

• å utvikle standardiserte metoder for testing av fenotypisk resistens mot ulike biocidforbindelser
• å utføre analyse av bakterielle sekvensdata for biocidresistens ved bruk av materiale hentet fra harmonisert overvåking av fjørfe og mennesker
• å undersøke praksis og holdninger knyttet til bruk av biocider på fjørfegårder i europeiske land, inkludert Norge
• å undersøke samlokalisering av biocidresistensgener og antimikrobielle resistensgener, samt overføring av tilhørende mobile genetiske elementer, og å identifisere mulige nye genetiske markører for biocidresistens
• å kartlegge bruken av biocider på fjørfegårder, gjennomføre genomiske undersøkelser av biocidresistens, og bidra til kapasitetsbygging innen genomikk og bioinformatikk i Tanzania

Samarbeidspartnere

Norsk: Wageningen University (Netherlands, lead), Norwegian Veterinary Institute (Norway), Animal and Plant Health Agency (UK), Sciensano (Belgium), Tanzanian Veterinary Laboratory Agency (Tanzania)