Karin Lagesen

Seksjonsleder, Bioinformatikk og datavitenskap


Forskningsprosjekter

  • PisciNor

    Piscirickettsiose er en fremvoksende sykdom hos oppdrettet atlantisk laks i Norge, Skottland og Irland. Prosjektet vil primært undersøke likheter og forskjeller i håndteringen av sykdommen i disse landene, samt karakterisere populasjonsstrukturen til det sykdomsfremkallende agenset (Piscirickettsia salmonis) i Nord-Atlanteren.

    Prosjektperiode
    2025 - 2027
    Område
    Akvakultur, Bakteriologi, Biofilm, Bioinformatikk, Diagnostikk, Fiskehelse, Medieproduksjon, Molekylærbiologi
  • EUPAHW - SPAMR-VET

    Målet med prosjektet er å forbedre overvåkningen av viktige veterinære patogener og deres resistensprofiler.

    Prosjektperiode
    2023 - 2026
    Område
    Antibiotikaresistens, Bakteriologi, Bioinformatikk, Epidemiologi, Fiskehelse, Husdyrhelse, Molekylærbiologi, Parasittologi
  • OH4Surveillance

    One health for surveillance (OH4S) skal hjelpe Europa med å etablere en Én-helse-overvåking av smittestoffer hos dyr og i miljøet. Overvåkingen som har som mål å beskytte folkehelsen gjennom tidlig påvisning av såkalte tilsynekommende zoonotiske smittestoff (emerging zoonotic pathogens). Det vil si smittestoffer som enten har vært under kontroll og nå er på vei tilbake, eller smittestoffer som først nylig har vist seg å smitte fra dyr og miljø til mennesker.  

    Prosjektperiode
    2024 - 2026
    Område
    Bakteriologi, Bioinformatikk, Epidemiologi, Husdyrhelse, Molekylærbiologi, Mykologi, Parasittologi, Patologi, Risikovurdering, Serologi, Vilthelse, Virologi, Zoonoser
  • BactUlcer

    Bakterielle sårlidelser forårsaker store dyrevelferdsmessige og økonomiske problemer innen norsk sjøbasert lakseoppdrett. I dette FHF-finansierte prosjektet ledet av Veterinærinstituttet, vil vi studere de involverte bakterieartene, både fra sjøvann og fisk, for å bedre forståelsen av hvorfor bare noen få, spesifikke stammer av disse er overrepresentert blant laks med sår.

    Prosjektperiode
    2023 - 2026
    Område
    Bakteriologi, Bioinformatikk, Epidemiologi, Fiskehelse, Molekylærbiologi, Patologi
  • ICONIC

    Antimikrobiell resistens er en av verdens mest alvorlige trusler, og kunnskap om hvordan resistens utvikles, spres og kan forebygges er svært viktig for folke- og dyrehelse, og for matsikkerhet og bærekraft. 

    Prosjektperiode
    2022 - 2025
    Område
    Antibiotikaresistens, Bioinformatikk, Zoonoser
  • Tenacibaculum spp. som en årsak til atypisk vintersår i norske oppdrettslaks

    Tenacibaculose har forholdsvis nylig vokst frem som en alvorlig trussel for norsk oppdrettslaks. Det relative bidraget fra selve bakterien, produksjonsforhold og miljøfaktorer til utbrudd av tenacibaculose, er imidlertid ukjent. Det beskrevne prosjektet har blitt igangsatt for å identifisere risikofaktorer av betydning for utbrudd av tenacibaculose, identifisere og karaktersiere toksiner som forårsaker kliniske symptomer, og for å teste om antistoffer mot toksinene kan beskytte mot sykdommen.

    Prosjektperiode
    2017 - 2021
    Område
    Bakteriologi, Epidemiologi, Fiskehelse, Immunologi, Molekylærbiologi, Patologi, Serologi, Statistikk, Vaksinologi
  • QREC-MaP - Quinolone resistance despite low antimicrobial usage – mechanisms and possible preventive measures

    It is well known that usage of antimicrobials promotes the development and spread of resistance. In addition to resistance driven by antimicrobial usage, development and dissemination of antimicrobial resistance can occur through other mechanisms that are currently unidentified or otherwise poorly characterized or understood.
    Prosjektperiode
    2016 - 2019
    Område
    Antibiotikaresistens, Bakteriologi, Molekylærbiologi, Zoonoser
  • QREC-Risk - Quinolone resistant Escherichia coli in Norwegian poultry and their impact on humans

    Antimicrobial resistance has been recognized by the WHO as a global threat to public health.

    Prosjektperiode
    2016 - 2019
    Område
    Antibiotikaresistens, Bakteriologi, Molekylærbiologi, Zoonoser